Le contrôleur des affaires maritimes participe sous l'autorité de cadres A civils ou d'officiers, au contrôle de l'exécution des missions de l'Etat à terre et en mer, en matière de police, de sauvegarde des biens et des personnes et de réglementation des pêches et des cultures marines, ainsi qu'à toutes les tâches techniques, administratives et économiques qui incombent aux divers services dans lesquels il peut être affecté.

Ils peuvent être chargés de fonctions d'encadrement et de formation professionnelle.

Les contrôleurs de classe supérieure et de classe exceptionnelle peuvent être appelés à diriger des services ou parties de services et à coordonner les travaux d'autres contrôleurs.

Il intervient à titre principal dans l'une des spécialités suivantes :

- Spécialité navigation et sécurité
- Spécialité pêches, cultures marines et environnement
- Spécialité droit social et administration générale des affaires maritimes.

Les contrôleurs des affaires maritimes sont habilités, dans les conditions prévues par l'article 28 du code de procédure pénale, à rechercher et constater les infractions aux lois et règlements qu'ils sont chargés de faire appliquer.