En temps de paix, le médecin des armées prodigue en France des soins autant aux civils qu’aux militaires. Il assure en outre la visite médicale des volontaires. Près de 270 000 jeunes sont ainsi examinés chaque année par le service de santé des armées.

Il est également formé à la médecine d'urgence et de catastrophe.
En période de guerre, il agit directement sur le front afin de secourir les blessés.